特設驅潜隊は特設艦船部隊令第五十八條で規定される部隊で、特設驅潜艇、特設捕獲網艇又は特設防潜網艇二隻以上を以て編成することとされました。下記の特設驅潜隊編制に見られるよう、実際には特設捕獲網艇一隻を母艦とし特設驅潜艇二隻を加えた三隻で編成されたことが多く、特設防潜網艇が特設驅潜隊に編入された記録はありません。
特設驅潜隊は各其の編制に依り第五十一驅潜隊等と呼称されました。特設驅潜隊であっても呼称には「特設」はつかず単に第五十一驅潜隊であり第五十一特設驅潜隊でないことにご注意ください。
なお第一～第三十二驅潜隊は正規の驅潜艇で編成された驅潜隊に割り当てらたので特設驅潜隊には存在しません。
特設驅潜隊の職員及其の職務に付いては驅逐隊潜水隊水雷隊掃海隊驅潜隊令の規定を準用しました。
【第五十一驅潜隊】 16.01.15：内令第 29号：長門丸、第六昭和丸、東光丸 16.05.15：内令第 523号：第十二京丸、第十三京丸、東光丸 16.10.15：内令第1251号：第十二京丸、第十三京丸、第一號東光丸 17.05.31：内令第 980号：第五十一驅潜隊の項を削る
【第五十二驅潜隊】 16.01.15：内令第 29号：第五拓南丸、第十七昭南丸、長福丸 16.05.15：内令第 523号：第五拓南丸、第十七昭南丸、第十五福榮丸 16.10.15：内令第1251号：第五拓南丸、第十七昭南丸、第十五福榮丸 17.08.25：内令第1580号：第五拓南丸、第十七昭南丸 18.03.01：内令第 350号：第五十二驅潜隊の項を削る
【第五十三驅潜隊】 16.01.15：内令第 29号：第十一京丸、第二京丸、興嶺丸 16.10.15：内令第1251号：第二京丸、第十一京丸、興嶺丸 17.03.15：内令第 450号：第二京丸、興嶺丸 17.05.31：内令第 980号：第五十三驅潜隊の項を削る
【第五十四驅潜隊】 16.10.15：内令第1251号：第一昭南丸、第二昭南丸、長良丸 18.05.01：内令第 831号：第五十四驅潜隊の項を削る
【第五十五驅潜隊】 15.11.15：内令第 838号：第一元日丸、昭和丸、第三昭和丸、第五昭和丸 16.01.15：内令第 29号：第一元日丸、昭和丸、第三昭和丸、第五昭和丸 16.10.15：内令第1251号：第一元日丸、昭和丸、第三昭和丸、第五昭和丸 17.05.31：内令第 980号：第五十五驅潜隊の項を削る
【第五十六驅潜隊】 16.01.15：内令第 29号：第八玉丸、第三利丸、第五壽丸 16.10.15：内令第1251号：第八玉丸、第三利丸、第五壽丸 17.11.30：内令第2197号：第八玉丸、第三利丸 18.03.01：内令第 350号：第五十六驅潜隊の項を削る
【第五十七驅潜隊】 16.10.15：内令第1251号：第二拓南丸、第十五昭南丸、國光丸 17.10.20：内令第1936号：第二拓南丸、第十拓南丸、第八昭南丸、第十五昭南丸、國光丸 19.03.31：内令第 503号：第二拓南丸、第六拓南丸、第十拓南丸、第五昭南丸、第八昭南丸、國光丸 19.08.10：内令第 946号：第五十七驅潜隊の項を削る
【第五十八驅潜隊】 16.12.10：内令第1619号：第八昭南丸、第十拓南丸、厚榮丸 17.10.20：内令第1936号：第五十八驅潜隊の項を削る
【第五十九驅潜隊】 16.10.15：内令第1251号：第五昭南丸、第六昭南丸、昭福丸 17.08.25：内令第1580号：第五昭南丸、第六昭南丸 17.12.20：内令第2341号：第五十九驅潜隊の項を削る
【第六十驅潜隊】 16.10.15：内令第1251号：第八京丸、第十京丸、珠江丸 19.03.31：内令第 503号：第六十驅潜隊の項を削る
【第六十二驅潜隊】 16.01.15：内令第 29号：第六拓南丸、第七拓南丸、桂丸 16.10.15：内令第1251号：第六拓南丸、第七拓南丸、桂丸 18.02.15：内令第 250号：第六十二驅潜隊の項を削る
【第六十三驅潜隊】 16.09.01：内令第 998号：第三昭南丸、第三文丸 16.10.15：内令第1251号：第三昭南丸、第三文丸、第三壽丸 17.03.15：内令第 450号：第三昭南丸、第三文丸、第十一昭南丸、第三壽丸 19.03.31：内令第 503号：第六十三驅潜隊の項を削る
【第六十四驅潜隊】 16.09.01：内令第 998号：第十昭南丸、第十一昭南丸 16.10.15：内令第1251号：第十昭南丸、第十一昭南丸、鹿島丸 17.02.15：内令第 283号：第六十四驅潜隊の項を削る
【第六十五驅潜隊】 16.10.15：内令第1251号：第六京丸、第七京丸、宇治丸 19.03.31：内令第 503号：第六十五驅潜隊の項を削る
【第六十六驅潜隊】 16.10.15：内令第1251号：文丸、第二關丸 16.10.31：内令第1311号：文丸、第二關丸、興義丸 17.06.15：内令第1048号：第六十六驅潜隊の項を削る
【第九十一驅潜隊】 16.10.31：内令第1311号：第七昭南丸、第十二昭南丸、長江丸 18.05.01：内令第 831号：第九十一驅潜隊の項を削る
【第百十二驅潜隊】 19.10.01：内令第1139号：第八日東丸、第九日東丸、高津丸、第二高津丸、隼丸 20.07.15：内令第 646号：特設驅潜隊編制を廃止
【第百二十五驅潜隊】 17.12.29：内令第2430号：第十七日東丸、第十八日東丸、檜丸 19.09.15：内令第1085号：第百二十五驅潜隊の項を削る
【第五十一驅潜隊司令】 補 16.01.15：海軍中佐 阿部 信夫 免 17.05.31：海軍中佐 阿部 信夫
【第五十二驅潜隊司令】 補 16.01.15：海軍中佐 川島 良雄 免 16.10.01：海軍中佐 川島 良雄 補 16.10.01：海軍中佐 北野 亘 免 18.03.01：海軍中佐 北野 亘
【第五十三驅潜隊司令】 補 16.01.15：海軍中佐 土井 卓三 免 16.09.01：海軍中佐 土井 卓三 補 16.09.01：海軍大佐 西尾 不二彦 免 17.05.31：海軍大佐 西尾 不二彦
【第五十四驅潜隊司令】 補 16.10.15：海軍中佐 浜田 義一 免 17.05.15：海軍中佐 浜田 義一 補 17.05.15：海軍中佐 小倉 外吉 任 17.11.01：海軍大佐 小倉 外吉 免 18.05.01：海軍大佐 小倉 外吉
【第五十五驅潜隊司令】 補 15.11.15：海軍大佐 池田 七郎 免 17.04.20：海軍大佐 池田 七郎 補 17.04.20：海軍大佐 山下 深志 免 17.05.31：海軍大佐 山下 深志
【第五十六驅潜隊司令】 補 16.01.15：海軍少佐 氏家 忠三 免 17.08.31：海軍少佐 氏家 忠三 補 17.08.31：海軍中佐 緒方 友兄 免 18.03.01：海軍中佐 緒方 友兄
【第五十七驅潜隊司令】 補 16.10.15：海軍大佐 大道寺 邁 免 17.12.27：海軍大佐 大道寺 邁 補 17.12.27：海軍大佐 三浦 友三郎 免 18.10.16：海軍大佐 三浦 友三郎 補 18.10.16：海軍大佐 中野 勝次 任 19.06.13：海軍少将 中野 勝次 （戦死）
【第五十八驅潜隊司令】 補 16.12.10：海軍大佐 深町 譲 免 17.07.20：海軍大佐 深町 譲 補 17.07.20：海軍大佐 直塚 八郎 任 17.09.21：海軍少将 直塚 八郎 （戦死）
【第五十九驅潜隊司令】 補 16.10.15：海軍少佐 大橋 硠 任 17.08.07：海軍中佐 大橋 硠 （戦死）
【第六十驅潜隊司令】 補 16.10.15：海軍大佐 青木 節二 免 17.06.15：海軍大佐 青木 節二 補 17.06.15：海軍大佐 大島 良之助 免 17.09.25：海軍大佐 大島 良之助 補 17.09.25：海軍大佐 太原 進 免 18.11.29：海軍大佐 太原 進 補 18.11.29：海軍大佐 江口 松郎 免 19.03.31：海軍大佐 江口 松郎
【第六十二驅潜隊司令】 補 16.01.15：海軍中佐 中込 育三 免 16.09.01：海軍中佐 中込 育三 補 16.09.01：海軍中佐 塹江 乙矢 免 17.07.25：海軍中佐 塹江 乙矢 補 17.07.25：海軍少佐 西 哲雄 免 18.02.15：海軍少佐 西 哲雄
【第六十三驅潜隊司令】 補 16.09.01：海軍大佐 永田 良三 免 17.09.15：海軍大佐 永田 良三 補 17.09.15：海軍大佐 阿部 耕運 免 18.12.20：海軍大佐 阿部 耕運 補 18.12.20：海軍大佐 森野 草六郎 任 19.02.06：海軍少将 森野 草六郎（戦死）
【第六十四驅潜隊司令】 補 16.09.01：海軍大佐 大澤 一介 免 17.02.15：海軍大佐 大澤 一介
【第六十五驅潜隊司令】 補 16.10.15：海軍中佐 柏木 質 免 19.06.27：海軍中佐 柏木 質 補 19.06.27：海軍中佐 高崎 四郎 免 19.03.31：海軍中佐 高崎 四郎
【第六十六驅潜隊】 補 16.10.15：海軍中佐 秋永 三夫 免 17.06.15：海軍中佐 秋永 三夫
【第九十一驅潜隊司令】 補 16.10.31：海軍大佐 竹内 武直 免 17.11.15：海軍大佐 竹内 武直 補 17.11.15：海軍大佐 斑目 健介 免 18.05.01：海軍大佐 斑目 健介
【第百二十五驅潜隊司令】 補 17.12.29：海軍大佐 千知波 長次 免 18.12.20：海軍大佐 千知波 長次 補 18.12.20：海軍大佐 溪口 豪介 -- 19.02.15：海軍大佐 溪口 豪介 （兼補第四南遣艦隊司令部附） 免 19.09.15：海軍大佐 溪口 豪介
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